La ligne de liaison ne s'entend pas à la lecture

Bonjour,
Probablement parce que vous faites une confusion (du grand classique) entre les liaisons de prolongation (celles que vous voudriez entendre), voir: https://musescore.org/fr/manuel/liaisons-de-prolongation
et les liaisons de phrasé, voir: https://musescore.org/fr/manuel/liaisons-de-phras%C3%A9

En anglais, c'est "tie" et "slur", ce sont des liaisons... mais en français on les différencie d'une autre façon, donc l'une est dite de prolongation, et la seconde de phrasé (ou liaison, tout simplement)

Dans une partition, pour vérifier qui est qui, il faut cliquer sur la liaison, et regarder dans la barre de statut, en bas de la fenêtre principale. Vous aurez la réponse à votre question (l'écoute du fichier étant bien entendu un autre moyen de contrôle)
Par exemple:

ET

Et pour l'écoute, le petit fichier test joint: liaisons.mscz

Bonjour,
Je pense que ton problème peut se résoudre facilement,
A priori, lors de la transcription, tu as dû mettre sur tes notes des liaisons de "phrasé" et non des liaisons de "prolongation".
- Pour modifier: tu supprimes la liaison, tu sélectionnes le 1ère note à prolonger et tu fais "+" au clavier ou clic sur le logo "liaison de prolongation" dans la barre d'outil.
A savoir:
- liaison de prolongation -> + du clavier ou barre d'outil "liaison de prolongation.
- liaison de phrasé: -> raccourci "S" du clavier ou sélectionner dans la fenêtre "ligne" de la palette.

A l'écriture, prends de bonnes habitudes
Exemple: un Do sur une blanche qui se prolonge par une noire, tu sélectionnes la blanche (ou 6 au clavier), tu la places sur la portée en Do, tu sélectionnes une noire (5) et tu cliques sur "+", la noire se placera automatiquement sur la portée en Do avec la liaison de prolongation.
et si cette noire doit encore se prolonger par une croche, selectionne croche (4) et "+"
Facile non!