Alignement des accords dans la version 3.6

"Dois-je faire cette manoeuvre à chaque partition ?"

Non, mais avouez que c'est vraiment très simple de le faire, même pour chaque partition (différente par définition) : sélection d'un accord, changement de décalage, clic sur S. En 2/3 secondes, c'est plié.
Sinon, après avoir réglé ce décalage dans menu "Format" -> Style -> Styles de texte -> Symbole d'accord -> modifier le décalage -> Ok : "Enregistrer ce style" (parmi d'autres, ce serait préférable) dans menu "Format".
Puis à chaque nouvelle partition, "Charger" ce style dans le même menu.

Enfin, en cas de partition à la configuration identique (en termes d'instruments), adoptez la solution la plus facile, à savoir la création d'un Modèle. C'est une partition comme une autre, avec vos paramètres personnalisés. Il suffira de la placer dans le dossier des Modèles, et vous la retrouverez dans l'Assistant de création de partition à "Modèles personnalisés")

Pour ma part, s'il ne s'agit que de ce problème de décalage des accords, je ne m'embêterais pas à créer un style spécifique. Imaginons dans une partition la présence d'une ou quelques notes suraiguës et que votre style soit "balancé" (accords ni trop haut, ni trop bas). Ce style alors ne suffira pas: l'accord s'adaptera pour éviter une collision avec cette note. Et donc, il faudra refaire via l'Inspecteur! :)

(ou bien acceptez simplement que tous les accords ne soient pas strictement et systématiquement alignés)