Định dạng tập tin
MuseScore hỗ trợ một dãy rộng các định dạng tập tin khác nhau, những tập tin cho phép bạn chia sẻ và xuất bản bản nhạc trong định dạng trông tốt nhất mà mình cần.
Bạn có thể nhập dữ liệu từ các tập tin theo Tập tin → Mở... và xuất dữ liệu theo Tập tin → Xuất bản nhạc....
Ngoài ra có các định dạng chi tiết dưới đây, bạn có thể lưu trữ và chia sẻ bản nhạc của mình trên trang mạng MuseScore.com vào Tập tin → Lưu trực tuyến.... Xem thêm Chia sẻ bản nhạc trực tuyến.
Định dạng riêng của MuseScore
Có nhiều định dạng sử dụng bởi hộp thoại Tập tin → Lưu trữ hoặc nút 
Tập tin → Lưu trữ với....
Định dạng MuseScore (*.mscz)
MSCZ là định dạng tập tin chuẩn của MuseScore và nên dùng nhất.
Một bản nhạc được lưu trong định dạng này sẽ chiếm rất ít không gian đĩa cứng, nhưng giữ được tất cả thông tin cần thiết. Định dạng này là phiên bản nén ZIP-compressed của tập tin .mscx, nó cũng chứa được bất kỳ hình ảnh nào.
Định dạng không nén Uncompressed MuseScore (*.mscx)
MSCX là một định dạng tập tin không nén của MuseScore.
Một bản nhạc lưu trữ trong định dạng này sẽ duy trì mọi thông tin, ngoại trừ hình ảnh. Nó chỉ nên dùng khi bạn muốn lưu nội dung dưới dạng có thể sửa được bằng tay (tức là có thể sửa được bằng một trình soạn thảo văn bản nào đó).
Phiên bản trước của MuseScore sử dụng phần mở rộng tập tin là *.msc. Tuy nhiên, cái này xung đột với phần mở rộng tập tin của Microsoft Windows và đã bị khóa bởi một số nhà cung cấp email. Vì thế, nó được thay thế bằng phần mở rộng mới hơn MSCX.
Hai định dạng MSCZ và MSCX của MuseScore 2.0 không thể được đọc bởi MuseScore 1.3 hoặc cũ hơn, sử dụng →XML hay →MXL đối với việc này.
Lưu ý về phông chữ: MuseScore không nhúng các phông chữ trong tập tin, ngoại trừ FreeSerif, FreeSerifBold, FreeSerifItalic, FreeSerifBoldItalic và các họ phông FreeSans. Nếu bạn muốn chia sẻ một tập tin MuseScore với các nhóm khác, hãy chọn các phông chữ này cho chữ viết của mình, hoặc một phông chữ mà các nhóm khác cũng cài đặt nó. Khi một hệ thống không có các phông được chỉ định trong tập tin, MuseScore sẽ sử dụng một phông dự trữ - tuy nhiên, điều này có thể khiến bản nhạc của bạn hiển thị khác đi.
Các tập tin dự phòng MuseScore
Tập tin dự phòng MuseScore (*.mscz, hoặc *.mscx,)
Các tập tin sao lưu dự phòng được tạo tự động và lưu trong cùng thư mục với tập tin MuseScore bình thường của bạn. Tập tin dự phòng có thêm một dấu chấm ở đầu tên tập tin (.) và một dấu phẩy (,) tại cuối (ví dụ nếu tập tin bình thường của bạn là "untitled.mscz", thì tập tin sao lưu dự phòng sẽ là ".untitled.mscz,").
Bản sao lưu dự phòng sẽ chứa bản lưu trước đó của tập tin MuseScore và có thể sẽ trở nên quan trọng nếu bản sao bình thường của bạn bị lỗi, hoặc khi bạn cần tìm lại bản sao cũ hơn của bản nhạc.
Để mở tập tin sao lưu dự phòng MuseScore, dấu chấm và dấu phẩy nên được loại bỏ khỏi tên tập tin. Vì nó được lưu cùng thư mục với tập tin MuseScore bình thường của bạn, nên có lẽ cần tạo cho nó một cái tên duy nhất (ví dụ đổi ".untitled.mscz," thành "untitled-backup1.mscz").
Để nhìn thấy tập tin dự phòng MuseScore, bạn cần thay đổi thiết lập hệ thống thành "Show hidden files" (hiện các tập tin ẩn) . Xem thêm Cách lấy lại bản sao lưu dự phòng của bản nhạc (MuseScore 2.x).
Xem và in ấn (dùng cho xuất dữ liệu)
PDF (*.pdf)
Định dạng văn bản di động (PDF - viết tắt của Portable Document Format) thì lý tưởng cho việc chia sẻ bản nhạc của bạn với những người khác, những người không cần chỉnh sửa lại nội dung của nó. Hầu hết mọi người đều có một trình xem PDF trên máy tính, vì thế sẽ không cần cài thêm phần mềm nào khác để xem nó.
PNG (*.png)
Tập tin Portable Network Graphics (PNG) là một định dạng ảnh bitmap được hỗ trợ rộng rãi bởi các phần mềm trên Windows, Mac OS, và Linux.
Định dạng ảnh này thì đặc biệt phổ biến trên trang mạng. Bản nhạc có nhiều trang sẽ xuất ra một tập tin PNG cho từng trang. MuseScore sẽ tạo các ảnh y như chúng xuất hiện trên giấy in. Trong thẻ xuất dữ liệu Điều chỉnh → Thiết lập... (Mac: MuseScore → Thiết lập...), bạn có thể thiết lập độ phân giải và muốn dùng nền trong suốt hay không.
Nếu muốn tạo các ảnh chỉ chứa một phần của bản nhạc, có hoặc không có các biểu tượng trong màn ảnh, ví dụ các khung chèn, các nốt ẩn, và màu các nốt nằm ngoài âm vực cho phép, hãy xem chụp hình ảnh
SVG (*.svg)
Tập tin Scalable Vector Graphics (SVG) có thể được mở bởi hầu hết các trình duyệt trang mạng (ngoại trừ Internet Explorer trước phiên bản 9) và các phần mềm đồ họa vec-tơ. Tuy nhiên, hầu hết các phần mềm SVG không hỗ trợ phông chữ được nhúng, vì thế các phông MuseScore thích hợp phải được cài đặt để hiển thị các tập tin này cách chính xác.
Tập tin để nghe (dùng cho xuất dữ liệu)
WAV audio (*.wav)
WAV (Waveform Audio Format) là một định dạng âm thanh không nén.
Tập tin được phát triển bởi Microsoft và IBM, nó được hỗ trợ bởi các phần mềm trên Windows, Mac OS, và Linux. Nó là một định dạng lý tượng để sử dụng khi tạo các CD với chất lượng âm thanh đầy đủ được duy trì. Tuy nhiên, dung lượng tập tin lớn khiến nó khó chia sẽ qua email hoặc các trang mạng.
FLAC audio (*.flac)
Free Lossless Audio Codec (FLAC) là định dạng âm thanh nén.
Tập tin FLAC được ước lượng bằng nửa dung lượng tập tin âm thanh không nén và chất lượng thì tốt. Windows và Mac OS không hỗ trợ sẵn cho FLAC, nhưng phần mềm như VLC media player có thể chơi tập tin FLAC trên bất kỳ hệ điều hành nào.
Ogg Vorbis (*.ogg)
Ogg Vorbis được xem như một sự thay thế định dạng âm thanh phổ biến MP3 miễn phí về bản quyền.
Giống như MP3, tập tin Ogg Vorbis thì tương đối nhỏ (thường là 1/10 so với âm thanh không nén), nhưng chất lượng âm thanh bị mất. Windows và Mac OS không hỗ trợ sẵn cho Ogg Vorbis. Tuy nhiên, VLC media player và Firefox có thể chơi tập tin Ogg trên mọi hệ điều hành.
MP3 (*.mp3)
Tập tin MP3 thì tương đối nhỏ (thường là 1/10 so với tập tin âm thanh không nén), những chất lượng âm thanh bị mất.
Để có thể tạo tập tin MP3, cần một thư viện ngoài, lame_enc.dll (Windows) hoặc libmp3lame.dylib (Mac), được cài đặt. MuseScore sẽ hỏi bạn vị trí của nó. Bạn có thể tải nó về tại http://lame.buanzo.org/.
Vài người dùng mày Mac có thể thấy MuseScore đụng phải một lỗi khi nạp thư viện MP3.Vấn đề có thể là do thư viện đó là một thư viện 32 -bit. Thư viện 64-bit sẽ làm việc với MuseScore thì có sẵn tại http://www.thalictrum.com/en/products/lame.html (chú ý nó cần được đổi tên thành libmp3lame.dylib để MuseScore nhận ra).
Chia sẻ với phần mềm âm nhạc khác
MusicXML (*.xml)
MusicXML là một chuẩn thế giới cho việc lưu thông tin của một bản nhạc.
Đây là một định dạng nên dùng để chia sẽ bản nhạc giữa các trình soạn nhạc khác nhau, bao gồm Sibelius, Finale, và hơn 100 phần mềm khác.
Compressed MusicXML (*.mxl)
Compressed MusicXML tạo ra tập tin nhỏ hơn so với tập tin MusicXML chính quy.
Đây là một chuẩn mới hơn và không được hỗ trợ rộng rãi bởi các trình soạn nhạc khác tại thời điểm này.
MIDI (*.mid, *.midi, *.kar)
Musical Instrument Digital Interface (MIDI) là định dạng được hỗ trợ rộng rãi bởi sequencers và các phần mềm ký âm âm nhạc.
Tập tin MIDI được thiết kế cho việc phát nhạc và không chứa các thông tin bố trí bản nhạc như định dạng, cao độ, giọng, dấu hoa mỹ, dấu diễn đạt, dấu lặp, hoặc khóa nhạc, và các thứ khác. Để chia sẻ tập tin giữa các phần mềm ký âm âm nhạc, MusicXML thì nên dùng. Nếu bạn chỉ thích phát lại các bản nhạc, thì dùng MIDI.
MuseData (*.md) (dùng cho nhập dữ liệu)
MuseData là định dạng được phát triển bởi Walter B. Hewlett đầu năm 1983 như một phương tiện đầu tiên chia sẻ ký âm âm nhạc giữa các phần mềm.
Nó đã bị lu mờ bởi MusicXML, nhưng hàng ngàn bản nhạc trong định dạng này thì vẫn có sẵn trên mạng.
Capella (*.cap, *.capx) (dùng cho nhập dữ liệu)
Tập tin CAP và CAPX thì được tạo bởi trình soạn thảo bản nhạc "Capella".
MuseScore nhập dữ liệu khá chính xác từ phiên bản 2000 (3.0) hoặc cao hơn của Capella (2.x thì không làm việc, định dạng *.all từ phiên bản 1.x thì hoàn toàn không hỗ trợ).
Bagpipe Music Writer (*.bww) (dùng cho nhập dữ liệu)
Tập tin BWW được tạo bởi trình soạn thảo nhạc niche, "Bagpipe Music Writer".
BB (*.mgu, *.sgu) (dùng cho nhập dữ liệu)
Tập tin BB được tạo bởi phần mềm hòa nhạc, "Band-in-a-Box".
Hiện tại MuseScore đang thử nghiệm hỗ trợ cho tập tin này.
Overture (*.ove) (dùng cho nhập dữ liệu)
Tập tin OVE được tạo bởi trình soạn thảo nhạc "Overture".
Định dạng này chủ yếu phổ biến trong môi trường ngôn ngữ Trung Quốc, như Lục địa Trung Quốc, Hong Kong, và Taiwan.
Hiện tại MuseScore đang thử nghiệm hỗ trợ cho tập tin này.